Sequenziamento e analisi bioinformatica del genoma umano
Quando: 11/05/2011 | 11.00-12.30
Titolo: Sequenziamento e analisi bioinformatica del genoma umano
Dove: sala Auditorium, Via Roma 253 (Cagliari)
Relatore: Frederic Reinier
Abstract. Durante il seminario, dopo una rapida carrellata sull'insieme delle tecniche di sequenziamento individuate come "next-generation sequencing", si arriverà al dettaglio sui sistemi Illumina Genome Analyzer e HiSeq2000 entrambi presenti al CRS4, macchine "ad alta processività" in grado di operare con tempi e costi ridotti rispetto alle macchine di generazione precedente. Saranno inoltre presentati in dettaglio, i protocolli di analisi bioinformatiche sviluppate al CRS4 in collaborazione con i colleghi informatici e biologi. Si metterà l'accento sui metodi di allineamento di sequenze, sul "management" di un formato generico di dati e anche sulla parte relativa al controllo di qualità, indispensabile per garantire l'accuratezza del dato elaborato.
Parole chiave: DNA, Sequenziamento, next-generation sequencing, allineamento, calcolo parallelo, calcolo ad alte prestazioni, qualità dei dati.
Video introduttivo:
Scheda relatore (Frederic Reinier) [Pdf]
Slide [Slideshare CRS4]
Video completo del seminario (durata: 54 minuti):