Il progetto prevede di investigare sulla presenza di anticorpi contro epitopi specifici per la regione di legame con il recettore (RBD) della proteina Spyke del Coronavirus NL63 e di verificare se questi anticorpi cross-reagiscono con gli epitopi di SARS CoV-2 in diverse categorie di pazienti. Verrà utilizzata la piattaforme NGS per il sequenziamento genico e l’analisi bioinformatica del CRS4,che consente una caratterizzazione genetica approfondita della popolazione in studio. Verrà valutata la presenza di polimorfismi sui geni ACE2, TMPRSS2 (recettori di SARS CoV-2) e su 36 geni coinvolti nella modulazione della risposta infiammatoria e immunitaria.
Gli obittivi specifici del progetto prevedono: – Identificare con metodi computazionali gli epitopi specifici dei due coronavirus NL63 e CoV-2 ed epitopi omologhi in comune. – Sintetizzare gli epitopi specifici per testarli su sieri di pazienti con malattie autoimmuni, infiammatorie e neurodegenerative quali Diabete di tipo 1, Sclerosi Multipla, Artrite Reumatoide, Tiroidite di Hashimoto, Morbo di Crohn, Malattia di Parkinson e pazienti con tumore alla prostata e controlli sani. – Eseguire esperimenti di cross inibizione fra i diversi epitopi di HCoV-NL63 e SARS CoV-2 per valutare la presenza di anticorpi cross reattivi che potrebbero essere presenti nei sieri di pazienti positivi a HCoV-NL63 in epoca pre SARS CoV-2. – Identificare polimorfismi genetici per correlare la variabilità nella popolazione in esame rispetto alla suscettibilità/resistenza all’infezione da SARS-CoV-2 e rispetto alla gravità dei sintomi e alla risposta alle terapie.
