Sequenziamento e analisi bioinformatica del genoma umano (11/05/2011)

SEMINAR SERIES 2015
Energia Solare a concentrazione (Cagliari, 2 Dicembre 2015)
Sequenziamento esomico (Monserrato, 18 Novembre 2015)
GIS Partecipativo (Cagliari, 21 Ottobre 2015)
Smart Grids (Cagliari, 14 Ottobre 2015)
Digital Medicine (Cagliari, 7 Ottobre 2015)
Gestione dati Geografici e GIS: Sistemi No-SQL e Object-Relational (Cagliari, 30 Settembre 2015)
Visual Computing - Cultural Heritage (Cagliari, 30 Giugno 2015)
Visual Computing - Scalable Rendering (Cagliari, 17 Giugno 2015)
Big Data Management (Cagliari, 10 Giugno 2015)
Internet of Things (Cagliari, 3 Giugno 2015)
Analisi metabolomica e lipidomica, e Modellistica molecolare (Monserrato, 27 Maggio 2015)
Geofisica Applicata (Cagliari, 21 Maggio 2015)
Digital Asset Management (Cagliari, 13 Maggio 2015)
Simulazione Termofluidodinamica (Cagliari, 6 Maggio 2015)
Clima e Incendi Boschivi (Cagliari, 22 APRILE 2015)
Tossicologia in Silico (Monserrato, 18 Marzo 2015)
Modellistica Idrologica (Cagliari, 4 Marzo 2015)
SEMINAR SERIES 2012
Simulazione modellistica e strumenti informativi per la propagazione di incendi boschivi (22/03/2012)
Nuove tecnologie per l’esplorazione umana dello spazio (29/03/2012)
Energia solare a concentrazione. Parte 1 (19/04/2012)
Integrazione di dati multiscala in biologia (03/05/2012)
Tecnologie HPC e Cloud per applicazioni di ingegneria e scienze ambientali (24/05/2011)
Servizi location-based e Internet delle cose (14/06/2012)
Inpeco and CRS4: industry meets research for traceability in healthcare (05/07/2012)
Online Analytics: Advertising Systems, Opinion Mining and the Semantic Web (06/09/2012)
Archiviazione e catalogazione delle immagini fotografiche digitali (20/09/2012)
Visual Computing (04/10/2012)
Applicazioni di telemedicina in real-time (25/10/2012)
Standard internazionali e linee guida per il software nel settore della salute (25/10/2012)
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Energia solare a concentrazione. Parte 2 (13/12/2012)
VOICES - Vocal Messages through mobile in Africa (13/12/2012)
SEMINAR SERIES 2011
High throughput genotyping and next generation sequencing (16/02/2011)
Information technology e DNA, dal 1953 ad oggi (15/03/2011)
Studi di associazione genetica e disegno sperimentale "caso-controllo" (30/3/2011)
Medicine goes digital (20/4/2011)
Sequenziamento e analisi bioinformatica del genoma umano (11/05/2011)
Approccio integrato alla gestione dati in ambito clinico e genetico (25/05/2011)
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Un approccio integrato della biologia dei sistemi (21/12/2011)

Sequenziamento e analisi bioinformatica del genoma umano

Quando: 11/05/2011 | 11.00-12.30
Titolo: Sequenziamento e analisi bioinformatica del genoma umano
Dove: sala Auditorium, Via Roma 253 (Cagliari)
Relatore: Frederic Reinier

Abstract. Durante il seminario, dopo una rapida carrellata sull'insieme delle tecniche di sequenziamento individuate come "next-generation sequencing", si arriverà al dettaglio sui sistemi Illumina Genome Analyzer e HiSeq2000 entrambi presenti al CRS4, macchine "ad alta processività" in grado di operare con tempi e costi ridotti rispetto alle macchine di generazione precedente. Saranno inoltre presentati in dettaglio, i protocolli di analisi bioinformatiche sviluppate al CRS4 in collaborazione con i colleghi informatici e biologi. Si metterà l'accento sui metodi di allineamento di sequenze, sul "management" di un formato generico di dati e anche sulla parte relativa al controllo di qualità, indispensabile per garantire l'accuratezza del dato elaborato.

Parole chiave: DNA, Sequenziamento, next-generation sequencing, allineamento, calcolo parallelo, calcolo ad alte prestazioni, qualità dei dati.

locandina_seminario_reinier

Video introduttivo:

Scheda relatore (Frederic Reinier) [Pdf]

Slide [Slideshare CRS4]

Video completo del seminario (durata: 54 minuti):

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