L’inferenza statistica e la lettura dei dati (22/06/2011)

SEMINAR SERIES 2015
Energia Solare a concentrazione (Cagliari, 2 Dicembre 2015)
Sequenziamento esomico (Monserrato, 18 Novembre 2015)
GIS Partecipativo (Cagliari, 21 Ottobre 2015)
Smart Grids (Cagliari, 14 Ottobre 2015)
Digital Medicine (Cagliari, 7 Ottobre 2015)
Gestione dati Geografici e GIS: Sistemi No-SQL e Object-Relational (Cagliari, 30 Settembre 2015)
Visual Computing - Cultural Heritage (Cagliari, 30 Giugno 2015)
Visual Computing - Scalable Rendering (Cagliari, 17 Giugno 2015)
Big Data Management (Cagliari, 10 Giugno 2015)
Internet of Things (Cagliari, 3 Giugno 2015)
Analisi metabolomica e lipidomica, e Modellistica molecolare (Monserrato, 27 Maggio 2015)
Geofisica Applicata (Cagliari, 21 Maggio 2015)
Digital Asset Management (Cagliari, 13 Maggio 2015)
Simulazione Termofluidodinamica (Cagliari, 6 Maggio 2015)
Clima e Incendi Boschivi (Cagliari, 22 APRILE 2015)
Tossicologia in Silico (Monserrato, 18 Marzo 2015)
Modellistica Idrologica (Cagliari, 4 Marzo 2015)
SEMINAR SERIES 2012
Simulazione modellistica e strumenti informativi per la propagazione di incendi boschivi (22/03/2012)
Nuove tecnologie per l’esplorazione umana dello spazio (29/03/2012)
Energia solare a concentrazione. Parte 1 (19/04/2012)
Integrazione di dati multiscala in biologia (03/05/2012)
Tecnologie HPC e Cloud per applicazioni di ingegneria e scienze ambientali (24/05/2011)
Servizi location-based e Internet delle cose (14/06/2012)
Inpeco and CRS4: industry meets research for traceability in healthcare (05/07/2012)
Online Analytics: Advertising Systems, Opinion Mining and the Semantic Web (06/09/2012)
Archiviazione e catalogazione delle immagini fotografiche digitali (20/09/2012)
Visual Computing (04/10/2012)
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Standard internazionali e linee guida per il software nel settore della salute (25/10/2012)
High Performance Computing and Network (8/11/2012)
Energia solare a concentrazione. Parte 2 (13/12/2012)
VOICES - Vocal Messages through mobile in Africa (13/12/2012)
SEMINAR SERIES 2011
High throughput genotyping and next generation sequencing (16/02/2011)
Information technology e DNA, dal 1953 ad oggi (15/03/2011)
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Medicine goes digital (20/4/2011)
Sequenziamento e analisi bioinformatica del genoma umano (11/05/2011)
Approccio integrato alla gestione dati in ambito clinico e genetico (25/05/2011)
Applicazione in campo Bio Medico del Modelling di Proteine (01/06/2011)
L’inferenza statistica e la lettura dei dati (22/06/2011)
Malattie autoimmuni comuni in Sardegna (13/07/2011)
Laboratory Information Management System-LIMS perché e per cosa? (14/09/2011)
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Modellazione matematica e codici di simulazione (19/10/2011)
Rapporti tra ricerca, tecnologia e applicazioni industriali nel campo dell'energia solare concentrata (19/10/2011)
Turbolenza: l'ultimo problema irrisolto della meccanica classica (30/11/2011)
Un approccio integrato della biologia dei sistemi (21/12/2011)

L’inferenza statistica e la lettura dei dati

il caso della interazione tra Citokine e MT-gase

Quando: 01/06/2011 | 16.30-18.00
Titolo: Applicazione in campo Bio Medico del Modelling di Proteine
Dove: Aula Magna Dip. Fisica, Cittadella Universitaria (Monserrato)
Relatore: Serena Sanna

Abstract. Negli ultimi anni si ha la possibilità di studiare il DNA con una risoluzione sempre piú accurata, ma il costo per alcuni esperimenti è ancora inaccessibile, soprattutto se si intende condurre degli studi su centinaia o migliaia di soggetti. Grazie ai concetti dell'inferenza statistica e della genetica si è capito che dei progressi possono essere fatti studiando in dettaglio il DNA di un numero relativamente ristretto di individui. Se si dispone ad esempio di un insieme di sequenze di riferimento, ottenute localmente o in altri laboratori, è possibile identificare la sequenza piú simile all'individuo in studio, di cui si hanno solo dati parziali, confrontando le basi nucleotidiche alle posizioni comuni. Si può così sequenziare, probabilisticamente, il DNA di decine di migliaia di persone, abbattendo fortemente i costi di laboratorio e aumentando notevolmente la probabilità di identificare le componenti genetiche associate a malattie. In questo seminario verranno illustrati i metodi statistici e i concetti genetici che stanno alla base di questo approccio, strumento ormai essenziale nell'era del sequenziamento genomico. Verranno discusse utilità e performances in diversi modelli sperimentali, e presentate le applicazioni sui progetti in collaborazione tra il CRS4 e il CNR.

Parole chiave: GWAS, genetica, inferenza statistica, sequenziamento, HapMap, 1000 Genomes, polimorfismi, aplotipi, linkage disequilibrium.

Locandina seminario

Video introduttivo:

Scheda relatore (Serena Sanna) [Pdf]

Slide [Slideshare CRS4]

Video completo del seminario (durata: 49' 24''):

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