Nuovo corso ECM (Educazione Continua in Medicina) organizzato dal CRS4 con il supporto dell'Azienda Ospedaliero Universitaria di Cagliari: "Analisi dati Next Generation Sequencing in Galaxy". Il corso si svolgerà dal 18 al 20 Novembre 2014 nelle Aule formazione del Parco Scientifico e Tecnologico Polaris, Edificio 2, Pula (Cagliari). Partendo dall'esperienza di ricerca del CRS4 nello studio, nell'integrazione e nell'analisi di dati di genomica, trascrittomica e metagenomica, il corso verterà sull'uso di Galaxy, un framework computazionale aperto basato sul web, che permette ai ricercatori senza particolari competenze di programmazione di condurre sofisticate analisi sui dati.
Il corso, della durata di tre giorni, è rivolto a medici, biologi, tecnici e ricercatori delle Scienze della Vita che lavorano o sono interessati a lavorare con dati di sequenziamento di prossima generazione. Ai partecipanti si forniranno le basi teoriche e pratiche per l'analisi bioinformatica di dati di NGS. Verranno presentati i principali campi di applicazione offerti dalla tecnologia NGS, le relative metodologie e gli algoritmi per l'analisi bioinformatica e gli strumenti attualmente disponibili, con particolare riferimento all'identificazione di varianti (exome sequencing), lo studio dell'espressione genica (RNA-Seq) e l'analisi metagenomica. Oltre la metà del corso consiste in esercitazioni pratiche guidate su casi studio allo scopo di verificare l'apprendimento dei flussi di lavoro affrontati durante le lezioni teoriche.
Queste attività sono parte integrante del processo che il CRS4 ha avviato per rendere accessibili al contesto regionale le sue principali infrastrutture di ricerca dedicate alle scienze della vita, nel quadro delle iniziative del Centro Regionale di Programmazione della Regione Autonoma della Sardegna finalizzate alla realizzazione di un sistema integrato della ricerca regionale
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Analisi dati Next Generation Sequencing in Galaxy